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Flex與OT-2在NGS應(yīng)用中的區(qū)別是什么?

在自動(dòng)化建庫(kù)需求日益增長(zhǎng)的背景下,實(shí)驗(yàn)室越來越重視平臺(tái)的選擇。Opentrons推出的OT-2和Flex高通量NGS平臺(tái)是兩款具有代表性的自動(dòng)化系統(tǒng)。它們?cè)谠O(shè)計(jì)理念、性能配置和使用場(chǎng)景上有顯著差異。本文將從五個(gè)核心維度,深入解析這兩款平臺(tái)在NGS(下一代測(cè)序)應(yīng)用中的主要區(qū)別,幫助實(shí)驗(yàn)人員做出更有針對(duì)性的決策。

Flex與OT-2在NGS應(yīng)用中的區(qū)別是什么?

移液工作站

一、平臺(tái)定位差異:入門級(jí)與高性能的對(duì)比
OT-2定位為入門級(jí)自動(dòng)化平臺(tái),設(shè)計(jì)初衷是讓更多中小型實(shí)驗(yàn)室以低成本快速接觸自動(dòng)化移液流程。其配置簡(jiǎn)潔、易于部署,適合試點(diǎn)階段的NGS建庫(kù)實(shí)驗(yàn)。
而Flex高通量NGS平臺(tái)則是面向高通量、流程復(fù)雜、樣本多樣的專業(yè)環(huán)境打造的。它強(qiáng)調(diào)性能、效率和流程覆蓋度,是成熟實(shí)驗(yàn)室實(shí)現(xiàn)建庫(kù)流程全面自動(dòng)化的核心設(shè)備。

二、硬件配置和通量能力不同
OT-2采用單臂結(jié)構(gòu),支持單通道或八通道移液模組,適合處理中低樣本量。它能兼容部分模塊(如加熱、磁力),但整體處理能力相對(duì)有限。
Flex平臺(tái)采用多模塊并行結(jié)構(gòu),可搭載多通道移液頭、高通量處理模塊、磁珠純化組件等,具備多孔板并行運(yùn)行能力,顯著提升通量與速度,特別適合需要高效文庫(kù)建庫(kù)的實(shí)驗(yàn)室。

三、流程支持程度的差異
在NGS建庫(kù)流程中,OT-2可以完成基本步驟如試劑分裝、樣本轉(zhuǎn)移和PCR準(zhǔn)備等,適用于流程相對(duì)簡(jiǎn)單的文庫(kù)建庫(kù)任務(wù)。然而對(duì)于磁珠純化、溫控反應(yīng)或多步酶處理,它的自動(dòng)化程度有限。
Flex平臺(tái)則覆蓋了從樣本分裝、DNA片段化、末端修復(fù)、接頭連接、磁珠純化、PCR擴(kuò)增到文庫(kù)洗脫的全流程,真正實(shí)現(xiàn)了一鍵式的NGS建庫(kù)自動(dòng)化。

四、軟件與操作體驗(yàn)的區(qū)別
OT-2的軟件界面適合初學(xué)者,操作簡(jiǎn)單直觀,用戶可以通過可視化界面完成基本流程設(shè)置。但它對(duì)流程復(fù)雜度的支持有限,適合標(biāo)準(zhǔn)化實(shí)驗(yàn)。
相比之下,F(xiàn)lex平臺(tái)的軟件系統(tǒng)支持邏輯控制、自定義參數(shù)、過程追蹤等功能,能滿足高級(jí)用戶對(duì)靈活性和流程細(xì)化的需求。此外,它支持與實(shí)驗(yàn)室信息管理系統(tǒng)(LIMS)對(duì)接,適合大規(guī)模項(xiàng)目和商業(yè)服務(wù)場(chǎng)景。

五、投資與擴(kuò)展性考量
OT-2的成本低、部署快,是中小實(shí)驗(yàn)室探索自動(dòng)化的理想起點(diǎn)。但其功能邊界固定,不適合未來通量持續(xù)增長(zhǎng)或流程升級(jí)的場(chǎng)景。
Flex高通量NGS平臺(tái)雖然初始投入相對(duì)更高,但支持模塊拓展、通道升級(jí)、流程定制,是一款適應(yīng)實(shí)驗(yàn)室長(zhǎng)期發(fā)展、具有高度擴(kuò)展?jié)摿Φ淖詣?dòng)化平臺(tái)。

如何選擇?
如果您所在的實(shí)驗(yàn)室處于起步階段,希望以較小預(yù)算實(shí)現(xiàn)基本的自動(dòng)化建庫(kù)流程,OT-2是一個(gè)不錯(cuò)的選擇。它能幫助您快速提升效率,減少手動(dòng)誤差,探索自動(dòng)化的基礎(chǔ)價(jià)值。
但如果您已面對(duì)大量樣本處理壓力,或希望將建庫(kù)流程納入標(biāo)準(zhǔn)化自動(dòng)系統(tǒng),同時(shí)提升數(shù)據(jù)一致性與操作可追溯性,那么Flex高通量NGS平臺(tái)無疑是更適合長(zhǎng)期發(fā)展的選擇。

如需進(jìn)一步了解這兩款平臺(tái)在您具體項(xiàng)目中的適配度,歡迎聯(lián)系Opentrons技術(shù)團(tuán)隊(duì),我們將為您提供場(chǎng)景分析與定制化建議,助力您的NGS項(xiàng)目高效起步、穩(wěn)步擴(kuò)展。

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