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Opentrons Flex 能自動完成酶解消化嗎？

在蛋白質(zhì)組學(xué)和質(zhì)譜樣品前處理中，酶解消化是影響結(jié)果質(zhì)量的關(guān)鍵步驟。然而人工操作不僅耗時(shí)長，還容易因?yàn)橐埔赫`差或孵育不穩(wěn)定造成重復(fù)性差。隨著實(shí)驗(yàn)室自動化普及，Opentrons Flex 具備完成酶解所需的移液、控溫、混勻和純化等功能，可以輕松實(shí)現(xiàn)從加酶到消化結(jié)束的自動化流程。

移液工作站

Flex 為什么能做酶解？

Opentrons Flex 是一套模塊化設(shè)計(jì)的自動化液體處理工作站。它不僅能精準(zhǔn)移液，還能搭配加熱振蕩模塊進(jìn)行控溫反應(yīng)，并可連接磁力模塊執(zhí)行酶解后的純化步驟。由于酶解過程主要需要加樣、混合、控溫和偶爾的清洗步驟，F(xiàn)lex 的功能剛好滿足這些需求。例如在胰蛋白酶消化過程中，F(xiàn)lex 可以自動加入酶溶液，完成混勻，然后在設(shè)定溫度下持續(xù)孵育數(shù)小時(shí)，全程無需人工干預(yù)。此外，若實(shí)驗(yàn)流程需要磁珠法純化，F(xiàn)lex 也能自動執(zhí)行吸附、洗滌和洗脫等步驟，實(shí)現(xiàn)完整的蛋白質(zhì)前處理。

自動酶解的大致流程

在 Flex 上進(jìn)行酶解時(shí)，流程通常從自動加樣開始。系統(tǒng)會根據(jù)預(yù)設(shè)程序把蛋白樣品與酶液加入指定孔位，隨后進(jìn)行輕柔混合，使反應(yīng)充分接觸。接著啟動加熱振蕩模塊，讓孔板在適當(dāng)溫度（如 37℃）持續(xù)孵育，以確保酶解反應(yīng)順利進(jìn)行。酶解結(jié)束后，如果實(shí)驗(yàn)采用磁珠純化步驟，F(xiàn)lex 可繼續(xù)完成后續(xù)清洗與洗脫，并最終得到可用于 LC-MS/MS 的干凈肽段。整個過程都可以在無人值守的情況下順利完成，非常適合需要批量處理的實(shí)驗(yàn)室。

Flex 自動酶解的主要優(yōu)勢

首先，F(xiàn)lex 能顯著減少人工操作時(shí)間。傳統(tǒng)酶解可能需要研究人員頻繁檢查溫度、補(bǔ)液或混勻，而自動化能讓這些步驟穩(wěn)定、連續(xù)地完成。其次，自動移液的精度更高，使酶與樣品的比例更一致，有助于提升實(shí)驗(yàn)重復(fù)性。再者，F(xiàn)lex 特別適合處理大量樣本，在 96 孔或 384 孔板上運(yùn)行時(shí)，其效率遠(yuǎn)超人工操作。對于需要經(jīng)常進(jìn)行質(zhì)譜樣品準(zhǔn)備的團(tuán)隊(duì)來說，這種高通量能力可以極大提升整體實(shí)驗(yàn)效率。此外，由于自動化能減少人為誤差，數(shù)據(jù)的可比性和一致性也會隨之提高，特別適用于需要長期穩(wěn)定流程的科研與企業(yè)實(shí)驗(yàn)室。

使用 Flex 進(jìn)行酶解時(shí)的注意事項(xiàng)

雖然 Flex 能勝任大多數(shù)酶解流程，但要實(shí)現(xiàn)完全自動化，仍需要正確配置模塊，例如加熱振蕩模塊和磁力模塊。如果流程包含變性、還原、烷基化等前處理步驟，也需要在 protocol 中合理安排順序和溫度。此外，每個實(shí)驗(yàn)室的樣品類型不同，可能需要對默認(rèn)流程進(jìn)行一些小幅調(diào)整，例如改變孵育時(shí)間或混合強(qiáng)度。對于少量樣本的實(shí)驗(yàn)來說，自動化的成本優(yōu)勢不明顯，但當(dāng)樣本數(shù)量達(dá)到一定規(guī)模時(shí)，F(xiàn)lex 的效率與一致性，會帶來非常明顯的收益。

結(jié)語

總體而言，Opentrons Flex 完全具備自動完成酶解消化的能力。它能讓整個流程更加高效、穩(wěn)定、可控，尤其適合蛋白質(zhì)組學(xué)和質(zhì)譜實(shí)驗(yàn)室的高通量需求。只要搭配合適模塊并設(shè)置好流程，F(xiàn)lex 就能幫助實(shí)驗(yàn)人員節(jié)省大量時(shí)間，同時(shí)提升數(shù)據(jù)質(zhì)量，為實(shí)驗(yàn)室?guī)砀叩淖詣踊健?/p>

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